中医对抽动-秽语综合症的病因认识分为先后天因素，先天禀赋因素是：孕妇妊娠期间的健康状况，特别是精神状况，曾用药物及难产、早产、剖腹产所致的小儿颅脑外伤或缺血、缺氧致患儿身体虚弱，阴阳失调；后天因素：饮食不当，营养不良，可造成小儿气血亏虚，心肝失养，血脉不畅；情感不舒，精神抑郁，可造成肝气郁结，肝郁日久，化火动风；情绪过于激动，阳亢无制，婴儿期的各种疾病，均可造成气血逆乱，而心神失养。外邪侵袭，郁热化燥，筋脉失养则挛急而自动。总之，先天与后天的共同原因，造成阴阳失调，阳胜则热；气血不足，阴虚内热是其主要病因。
当事物处于沉静状态时，属阴，处于躁动状态时，属阳。故，静属阴，动属阳，阴阳是相互对立的。阴阳之间，一方面表现为阴可以变为阳，阳可以变为阴，阴阳相互转化；另一方面，阴阳之中可以再分阴阳，正如《素问·宝命全形论》所说：人生有形，不离阴阳，阴阳平衡，则动静协调；阴阳失调，则动静错乱，正所谓阴平阳秘，精神乃治；阴阳离绝，精气乃绝。
精属肾，肾藏精。精是人体生命活动的物质基础。 可分为先天之精和后天之精。先天之精，禀受于父母，也就是说，人初成形（即精子与卵子相结合），即已有先天之精作原始物质；后天之精，来源于后天的饮食水谷。后天的饮食物经胃之受纳腐熟、肾之蒸腾气化而成精微，谓之后天之精，营养五脏，灌溉六腑，是各脏腑活动的物质基础。故人体由先天之精作基础，后天之精不断补助，两者相互依存，互相为用。因此，小儿生长发育的迅速，必须要依赖阴精的充分补充，一旦阴精不足，可造成注意力不集中，健忘等症状；阴精的不足，也可致阴阳失调，筋脉失养，则抽动不止。
脾气虚弱，健运失司，水湿凝聚，则为痰饮，痰浊蒙蔽清窍则神机不能畅达而出现不自主动作及不自主秽语；外邪袭表，肺气不宣，风火夹痰阻滞咽喉，咽喉不利则出现喉中异常发音。
肝血不足，血不养筋，肝风内动，可出现筋肉痉挛，缩脖、皱眉、眨眼诸征。肝喜条达而恶拂郁，条达太过则为亢害，情绪受挫则为拂郁，故以呼叫叹息为快而异常发音。
肾主水，心主火，肾阴不足，水火失济，则心神烦躁，魂不守舍，从而出现语言颠三倒四或有秽语，流露心神病变。
肾阴虚弱，肝火旺盛，则可见舌质红绛，苔少或光剥，脾气暴躁和行为障碍等一系列抽动-秽语综合征的症状。
总之，阴阳失调，阴虚阳亢，是其主要发病机理，肾阴不足，肝阳上亢，五内燥热，痰湿阻滞是其主要致病因素。
