台湾的融合教育是有阶段性的。1980年代孤独症这个词在台湾出现，1990年代，融合教育思潮进入台湾，开始强调教育不能隔离，目前台湾的小学都至少有2位特教老师，早期台湾设立的启明、启聪等特殊教育学校，后在融合教育思潮冲击下，逐渐萎缩，学生逐渐回归普通学校。
如果家长不愿孤独症孩子离开普通学校，即使孩子不能站立，课堂上要换尿片，学校也会尊重家长的意见让他们继续留在普通学校上课。
台湾师范大学特教硕士、台北中山国小特教老师郭色娇介绍道，在台湾强调教育不能隔离。孤独症孩子上学有三种安排，一部分放在普通班和其他孩子一起上课，有特殊教育需要就在课堂外额外进行；一部分设在一般学校的特殊班；重症孩子才放在特殊学校内。但这些安排都要征询家长的意见。
郭色娇认为，不同孩子一起成长，一方面孤独症孩子不觉得自己特殊，另一方面普通孩子也不觉得这些同伴该隔离，两类孩子从小就和谐相处，减少潜在的社会问题滋生。
据悉，如果孤独症小孩有暴力倾向，干扰课堂秩序，台湾的学校或教育主管部门会派特教助理帮助处理。普通班的老师如果不知怎么带孤独症孩子，或者孤独症孩子与其他孩子发生冲突，家长有不同声音，除了及时干预和处理外，教育主管部门会利用寒暑假，对普通班老师和家长进行特教宣导，或进行强迫型培训，且随时给学校和家长提供帮助，其费用由台湾财政承担。
